La Escuela de Agronomía fue creada, mediante la Ley 48 del 20 de noviembre de 1958; su primer director fue el Ingeniero Enrique Enseñat. En 1959 funcionó en el campus central como una unidad adscrita a la facultad de Ciencias Naturales y Farmacia. Dado el sólido status académico que adquiere la escuela de Agronomía, en 1965, se convierte en la facultad de Agronomía. Luego de su reestructuración académico-administrativa, en 1986, cambia su nombre a facultad de Ciencias Agropecuarias, y se crean formalmente cinco escuelas y seis departamentos académicos. Actualmente, esta unidad académica la conforman 6 escuelas: Ciencias Agrícolas, Ciencias Pecuarias, Suelos y Aguas, Desarrollo Agropecuario, Gastronomía y Ciencias de la Familia. La FCA tiene una amplia oferta académica, a nivel de pregrado, que se ha ido incrementado como respuesta a la demanda de matrícula y el interés que despierta la producción sostenible alimentaria en los jóvenes. En el área de la Gastronomía, se brinda el Técnico en Artes Culinarias y la Licenciatura en Gastronomía; para la de Familia está la Licenciatura en Ciencias de la Familia y Desarrollo Comunitario; en el programa de Ingenierías, se ofrecen con énfasis en Cultivos Tropicales, Producción Animal, Manejo de Cuencas y Ambiente, Agronegocios y Desarrollo Agropecuario. Existen cinco maestrías, cuatro de ellas en Ciencias Agrícolas con énfasis en Manejo de Suelos y Agua, Protección Vegetal, Producción Agrícola Sostenible, Manejo de Recursos Naturales y Ciencias de la Familia del Desarrollo Comunitario con énfasis Producción Comunitaria y Ecología Familiar. La Facultad de Ciencias Agropecuarias, luego de varias décadas, decide renovar su Identidad; por lo que, cambia su imagen representada por un logo de tres flechas, que identificaban las tres escuelas que existían antes, por un logo con una imagen más acorde a los retos actuales de la FCA. Luego de la evaluación de las diversas propuestas, la Junta de Facultad 1-2017, 8 de noviembre de 2017, eligió al logo que destaca las letras FCA, iniciales de la Facultad, las cuales desean que queden plasmadas en la mente de la familia universitaria, del Sector Agropecuario y de toda la comunidad panameña e internacional. Las ramas de olivo representan los logros y el verdor y parten de la fecha de creación de la Facultad. Todos estos elementos, dentro de un círculo, representan continuidad y progreso. El martes, 20 de noviembre, la FCA cumplió 60 años al servicio de la educación superior agropecuaria, la gastronomía y la familia.